Un número importante de las instituciones dedicadas a las Ciencias del Mar edita una publicación periódica exclusivamente dedicada a este tema. Ellas son:

• Biología Pesquera de la Universidad Católica de la Santísima Concepción.
• Biota de la Universidad de Los Lagos.
• Ciencia y Tecnología del Mar del Comité Oceanográfico Nacional
• Estudios Oceanológicos de la Universidad de Antofagasta.
• Gayana Oceanografía de la Universidad de Concepción.
• Investigaciones Marinas de la Universidad Católica de Valparaíso.
• Investigación Pesquera del Instituto de Fomento Pesquero.
• Revista de Biología Marina y Oceanografía de la Universidad de Valparaíso.

Además existen publicaciones que sin estar dedicadas específicamente al tema de las Ciencias del Mar, es común encontrar en ellas trabajos sobre el particular. Entre estas publicaciones denominadas periféricas, encontramos las siguientes:

• Anales del Instituto de la Patagonia de la Universidad de Magallanes.
• Boletín de la Sociedad de Biología de Concepción.
• Gayana Botánica y Gayana Zoología de la Universidad de Concepción.
• Medio Ambiente de la Universidad Austral de Chile.
• Revista del Museo Nacional de Historia Natural.
• Revista Chilena de Historia Natural de la Sociedad de Biología de Chile.
• Revista Geológica de Chile del Servicio Nacional de Geología y Minería.
• Serie Científica del Instituto Antártico Chileno.